MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae DSM 12163 plasmid pEp5

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017389	GGAC	2	8	531	538	25 %	0 %	50 %	25 %	387873350
2	NC_017389	CAGC	2	8	566	573	25 %	0 %	25 %	50 %	387873350
3	NC_017389	ACG	2	6	656	661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873350
4	NC_017389	GCGG	2	8	725	732	0 %	0 %	75 %	25 %	387873350
5	NC_017389	GCG	2	6	795	800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873350
6	NC_017389	GAA	2	6	812	817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873350
7	NC_017389	AGC	2	6	841	846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873350
8	NC_017389	GCG	2	6	882	887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873350
9	NC_017389	GCT	2	6	982	987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873351
10	NC_017389	A	8	8	1010	1017	100 %	0 %	0 %	0 %	387873351
11	NC_017389	ATG	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873351
12	NC_017389	GGT	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873351
13	NC_017389	AT	3	6	1261	1266	50 %	50 %	0 %	0 %	387873351
14	NC_017389	ACT	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873351
15	NC_017389	ATC	2	6	1344	1349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873351
16	NC_017389	AGA	2	6	1363	1368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873351
17	NC_017389	GAT	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873351
18	NC_017389	A	7	7	1520	1526	100 %	0 %	0 %	0 %	387873351
19	NC_017389	ATA	2	6	1542	1547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873351
20	NC_017389	GATAT	2	10	1611	1620	40 %	40 %	20 %	0 %	387873351
21	NC_017389	T	7	7	1655	1661	0 %	100 %	0 %	0 %	387873351
22	NC_017389	AAGAT	2	10	1686	1695	60 %	20 %	20 %	0 %	387873352
23	NC_017389	CAA	2	6	1736	1741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873352
24	NC_017389	ATA	2	6	1743	1748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873352
25	NC_017389	TA	3	6	1754	1759	50 %	50 %	0 %	0 %	387873352
26	NC_017389	TAT	2	6	1782	1787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387873352
27	NC_017389	CTT	4	12	1802	1813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873352
28	NC_017389	CTT	2	6	1856	1861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873352
29	NC_017389	T	6	6	1860	1865	0 %	100 %	0 %	0 %	387873352
30	NC_017389	T	6	6	1871	1876	0 %	100 %	0 %	0 %	387873352
31	NC_017389	AGA	2	6	1878	1883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873352
32	NC_017389	TCTT	2	8	1909	1916	0 %	75 %	0 %	25 %	387873352
33	NC_017389	CTT	2	6	1935	1940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873352
34	NC_017389	A	6	6	1960	1965	100 %	0 %	0 %	0 %	387873352
35	NC_017389	CCA	2	6	1978	1983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873352
36	NC_017389	T	7	7	2030	2036	0 %	100 %	0 %	0 %	387873352
37	NC_017389	CA	4	8	2079	2086	50 %	0 %	0 %	50 %	387873352
38	NC_017389	T	6	6	2097	2102	0 %	100 %	0 %	0 %	387873352
39	NC_017389	CTC	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387873352
40	NC_017389	GCA	2	6	2133	2138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873352
41	NC_017389	CGGA	2	8	2197	2204	25 %	0 %	50 %	25 %	387873352
42	NC_017389	GCA	2	6	2240	2245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873352
43	NC_017389	CAT	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873353
44	NC_017389	CGCTGT	2	12	2396	2407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
45	NC_017389	TCCAGC	2	12	2414	2425	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387873353
46	NC_017389	CTG	3	9	2431	2439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
47	NC_017389	CTG	2	6	2452	2457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
48	NC_017389	GCT	2	6	2501	2506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
49	NC_017389	CCTG	2	8	2522	2529	0 %	25 %	25 %	50 %	387873353
50	NC_017389	CGCT	2	8	2545	2552	0 %	25 %	25 %	50 %	387873353
51	NC_017389	AGT	2	6	2636	2641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873353
52	NC_017389	CTG	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
53	NC_017389	GCT	2	6	2651	2656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
54	NC_017389	TGC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
55	NC_017389	TTC	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873353
56	NC_017389	GCA	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873353
57	NC_017389	CG	3	6	2830	2835	0 %	0 %	50 %	50 %	387873353
58	NC_017389	CTG	2	6	2892	2897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
59	NC_017389	CCA	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873353
60	NC_017389	GAT	2	6	2955	2960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873353
61	NC_017389	GGC	2	6	3045	3050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873353
62	NC_017389	TTCTC	2	10	3056	3065	0 %	60 %	0 %	40 %	387873353
63	NC_017389	CTG	3	9	3138	3146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
64	NC_017389	C	6	6	3226	3231	0 %	0 %	0 %	100 %	387873353
65	NC_017389	ATGCTG	2	12	3245	3256	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387873353
66	NC_017389	GTG	2	6	3263	3268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873353
67	NC_017389	CAC	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873353
68	NC_017389	CTG	2	6	3372	3377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
69	NC_017389	GCTTT	2	10	3384	3393	0 %	60 %	20 %	20 %	387873353
70	NC_017389	CCG	2	6	3421	3426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873353
71	NC_017389	GCGG	2	8	3495	3502	0 %	0 %	75 %	25 %	387873353
72	NC_017389	CAG	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873353
73	NC_017389	GCC	2	6	3579	3584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873353
74	NC_017389	T	6	6	3730	3735	0 %	100 %	0 %	0 %	387873353
75	NC_017389	TCC	2	6	3770	3775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387873353
76	NC_017389	GCA	2	6	3786	3791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873353
77	NC_017389	CAG	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873353
78	NC_017389	GCC	3	9	3847	3855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873353
79	NC_017389	ATC	2	6	3881	3886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873353
80	NC_017389	GTT	2	6	4022	4027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387873356
81	NC_017389	AGC	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873356
82	NC_017389	GAAG	2	8	4068	4075	50 %	0 %	50 %	0 %	387873356
83	NC_017389	CAG	2	6	4154	4159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873356
84	NC_017389	TGC	2	6	4201	4206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873356

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.